En el marco del Acuerdo de Austeridad y Racionalidad del Gasto, se llevó a cabo en el año 2013 una reestructuración administrativa para optimizar los recursos humanos, sin desatender los programas institucionales en las prestaciones sociales y los servicios médicos, lo que permitió que de 92 plazas de jefatura de departamento, quedaran sólo 57, representando una reducción de 35 plazas y un ahorro anual de 25´millones, 450 mil, 891 pesos, equivalente al 18% del valor de la nómina del personal de confianza.

Referente a la plantilla del personal de base, esta se ha conservado conforme a la relación laboral y en el caso del personal supernumerario adscrito a los nuevos programas de atención de medicina familiar y de desconcentración regional del segundo nivel de atención, se incrementó en 117 plazas, que representa un importe aproximado de 10´millones, 617 mil, 750 pesos, lo que al final representa un ahorro anual de 14´millones, 833 mil, 141 pesos.